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生物信息学(Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

主要应用软件为:

BARRACUDA,CUDASW++,CUSHAW,NVBIO,NVBowtie,PEANUT,REANUT,REACTA,SeqNFind,SOAP3,UGENE,WIDELM,Materials Studio等 

联众集群高性能计算解决方案 

1.采用四路E5-4600V2系列(主频高于2.5GHZ4U超算平台,其适用于分子动力学应用,实现大规模并行

2.搭配采用GPU计算平台,NVIDIA TESLA K80/K40系列高性能计算卡,单机能容纳4GPU卡,CUDA核心数能达到19968核心

3.存储系统采用,多台72盘位大容量存储,单机容量达到288T;因为I/O压力比较大,因此存储读写性能要求快;同时数据量非常大

4.集群计算网络采用Infiniband FDR(56GB),管理网络采用万兆网络

5.管理及其应用软件,根据用户需求安装系统及搭建使用环境,软件环境包括基于Linux核心开发的操作及管理系统,提供MPI并行环境的搭建,GCC系列编译器,C,C++,fortran,java 等,并优化科学计算库BLAS/ATLAS/Lapack/ScalaPack/FFTW等以及源代码开放的计算与模拟软件等,高级工程师优化PBS作业管理与作业调度系统,依据用户的要求编写相关脚本。

6.联众集群所有节点采用80PLUS高效(96%)电源,提高电源转换效率,降低用户运维成本。结合集群管理监控软件,自动将空闲资源设置为待机或者关机状态,整体节能降低20%

      联众集群结合用户实际应用需求,帮助用户解决其应用难题,节约科研经费,这是我们一贯的工作态度

      详情致电:400-630-7530

      E-MAIL  :[email protected]

 
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